O PES engloba essencialmente quatro áreas de intervenção:
Saúde mental e prevenção da violência;
Educação alimentar e atividade física;
Prevenção dos comportamentos aditivos e dependências;
Afetos e educação para uma sexualidade responsável.
O desenvolvimento de atividades no âmbito destas áreas de intervenção decorre da estreita colaboração com a equipa de saúde escolar, tendo em vista o reconhecimento da saúde como um bem precioso e a tomada de consciência da responsabilidade de cada um na promoção da saúde individual e comunitária e no exercício de uma cidadania ativa.